รูอิตเกิดเมื่อวันที่ 4 กันยายน 1954 พ่อแม่ของเขาไม่มีการศึกษา (illiterate) ครอบครัวของรูอิตอยู่ในหมู่บ้านโอลางชุงโคลาบนเทือกเขาทุรกันดาร ใกล้กับพรมแดนของทิเบต ในอำเภอตาเปลชุง ทางตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศเนปาล หมู่บ้านเขามีครัวเรือนเพียง 200 คน และอยู๋สูง 11,000 ฟุตจากระดับน้ำทะเล นับเป็นหนึ่งในภูมิภาคที่ห่างไกลความเจริญที่สุดของประเทศเนปาล ไม่มีไฟฟ้า ไม่มีโรงเรียน ไม่มีบริการสุขภาพ และไม่มีการติดต่อสื่อสารแบบสมัยใหม่เข้าถึง บริเวณนี้ยังถูกปกคลุมอยู่ใต้หิมะยาวนานหกถึงเก้าเดือนต่อปี ครอบครัวรูอิตจุนเจือการเป็นอยู่อย่างพอตัวด้วยการเกษตรเล็ก ๆ การค้าายยิบย่อย และปศุสัตว์[11]

รูอิตเป็นลูกคนที่สองจากสี่คน พี่น้องทั้งสามคนของเขาเสียชีวิตด้วยโรคต่าง ๆ ที่สามารถรักษาหายได้ด้วยการแพทย์สมัยใหม่ พี่ชายเขาเสียชีวิตด้วยอาการท้องร่วงเมื่ออายุได้สามขวบ[12]:3–4 ส่วนน้องสาวเสียชีวิตจากกอาการไข้สูงเมื่ออายุได้แปดขวบ ในหลายการให้สัมภาษณ์หลายครั้ง รูอิตมักบอกเสมอว่านั่นคือสิ่งที่เจ็บปวดที่สุด เพราะเธอเป็นคนสำคัญที่สุดของเขา ด้วยเป็นน้องสาวคนเล็กสุด และลูกที่เหลืออยู่นอกจากตัวเขาเอง[12]:9 ได้เสียชีวิตลงเมื่ออายุ 15 ขวบด้วยวัณโรค สาเหตุด้วยเพราะครอบครัวของรูอิตยากจนเกินกว่าที่จะเข้ารับการรักษาได้ ทั้ง ๆ ที่เธอควรจะรอดชีวิตด้วยซ้ำ รูอิตบอกเสมอว่าความสูญเสียนี้เป็นแรงผลักดันสำคัญที่ทำให้ตัวเขาต้องเป็นแพทย์และจะตั้งมั่นประกอบอาชีพเพื่อคนยากไร้ที่ไม่สามารถเข้าถึงบริการสุขภาพได้[12]:37–40

โรงเรียนที่ใกล้บ้านเขาที่สุดอยู่ในดาร์จีลิง ต้องเดินเท้าไปเป็นเวลาสิบเอ็ดวัน[13] พ่อของเขาเห็นว่าการสำคัญของลูก ๆ สำคัญที่สุด จึงได้จัดให้รูอิตเข้าเรียนที่โรงเรียนเซนต์โรเบิร์ต (St Robert's School) ในดาร์จีลิง รูอิตจบการศึกษาจากโรงเรียนสิทธารถวนสถลี (Siddhartha Vanasthali School) ในกาฐมาณฑุ ประเทศเนปาล[ต้องการอ้างอิง] จากนั้นได้เข้าศึกษาต่อจนจบปริญญาวิชาชีพแพทย์ (MBBS) จากวิทยาลัยการแพทย์คิงจอร์จ (King George's Medical College) ในลัคเนา ประเทศอินเดีย และเข้าศึกษาต่อที่สถาบันวิทยาศาสตร์การแพทย์ออลล์อินเดีย เดลี (All India Institute of Medical Sciences, Delhi)[ต้องการอ้างอิง] นอกจากนี้เขายังมีโอกาสได้ศึกษาต่อในประเทศเนเธอร์แลนด์ ออสเตรเลีย และสหรัฐอเมริกา และมีอาจารย์ที่ปรึกษาชาวออสเตรเลียคือศาสตร์จารย์ นายแพทย์เฟรด ฮอลโลวส์ (Fred Hollows) จักษุแพทย์ที่มีความสามารถ[13]